Usměrněná evoluce myšího polyomaviru

• Thesis title in Czech: Usměrněná evoluce myšího polyomaviru
• Thesis title in English: Directed evolution of mouse polyomavirus
• Key words: usměrněná evoluce, myší polyomavirus, knihovna, mutanty, error-prone PCR, DNA shuffling, Cre/loxP systém
• English key words: directed evolution, mouse polyomavirus, library, mutants, error-prone PCR, DNA shuffling, Cre/loxP system
• Academic year of topic announcement: 2014/2015
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
• Supervisor: RNDr. Hana Španielová, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 10.11.2014
• Date of assignment: 03.12.2014
• Date of electronic submission: 15.08.2016
• Date of proceeded defence: 13.09.2016
• Opponents: RNDr. Tomáš Mašek, Ph.D.
• Advisors: RNDr. Jiřina Žáčková Suchanová, Ph.D.

Preliminary scope of work

Usměrněná evoluce je účinný přístup, který dovoluje relativně rychlou selekci a izolaci virových variant s novými a terapeuticky cennými vlastnostmi. Cílem této diplomové práce je vytvořit kvalitní a vysoce diversifikovanou knihovnu polyomavirových variant mutovaných v hlavním kapsidovém proteinuVP1. Pro přípravu mutant v Cre/loxP systému vyvinutém v laboratoři budou použity metody “error-prone PCR” a “DNA shuffling”.

Preliminary scope of work in English

Directed evolution is a powerful approach that enables relatively rapid selection and isolation of virus variants with novel and therapeutically valuable properties. The main goal of this diploma thesis is to create the high quality, high diversity libraries of polyomavirus variants mutated in main capsid protein VP1. The error-prone PCR and DNA shuffling methods will be used for preparation of mutants in Cre/loxP system developed in the laboratory.