 | On Thursday, September 4, 2025, from 8:00 PM to 10:00 PM, there will be an outage of WhoIs system. This will limit work in IS studium. For example, you will not be able to submit thesis. Subscription to courses should remain unaffected by the outage. We apologize for any inconveniece and we thank you for understanding. |
Properties and interactions of nucleoproteins studied by advanced lifetime-based imaging methods
| Thesis title in Czech: | Studium vlastností a interakcí nukleoproteinů pomocí pokročilých metod časově rozlišené fluorescenční mikroskopie |
|---|---|
| Thesis title in English: | Properties and interactions of nucleoproteins studied by advanced lifetime-based imaging methods |
| Key words: | homoFRET|heteroFRET|zobrazování pomocí anizotropie|FLIM|oligomerizace|nukleoproteiny |
| English key words: | homoFRET|heteroFRET|anisotropy imaging|FLIM|oligomerization|nucleoproteins |
| Academic year of topic announcement: | 2019/2020 |
| Thesis type: | diploma thesis |
| Thesis language: | angličtina |
| Department: | Institute of Physics of Charles University (32-FUUK) |
| Supervisor: | prof. RNDr. Petr Heřman, CSc. |
| Author: | hidden - assigned and confirmed by the Study Dept. |
| Date of registration: | 29.10.2019 |
| Date of assignment: | 29.10.2019 |
| Confirmed by Study dept. on: | 27.11.2019 |
| Date and time of defence: | 15.06.2022 09:00 |
| Date of electronic submission: | 05.05.2022 |
| Date of submission of printed version: | 05.05.2022 |
| Date of proceeded defence: | 15.06.2022 |
| Opponents: | RNDr. Jan Krůšek, CSc. |
| Advisors: | RNDr. Aleš Holoubek, Ph.D. |
| Mgr. Dita Strachotová, Ph.D. | |
| Guidelines |
| 1. Prostudovat určenou literaturu a sepsat rešerši.
2. Seznámit se s konfokálním fluorescenčním mikroskopem a zvládnout metodiku FLIM, FRET, homoFRET. 3. Zvládnout metodiku kultivace buněk se značeným NPM. 4. Získat, vyhodnotit a interpretovat buněčná FRET-FLIM data včetně vhodných kontrol. 6. Sepsat práci. |
| References |
| 1) Lakowicz JR,Principles of fluorescence spectroscopy, Third edition. Springer, New York, 2006
2) W. Becker, Advanced Time-Correlated Single Photon Counting Techniques Springer, Berlin, 2005 3) Kapusta, P., Wahl, M. and Erdmann, R. (Eds.), Advanced Photon Counting: Applications, Methods, Instrumentation, Springer International Publishing, London, 2015 4) Herman P, Lakowicz JR Lifetime-based imaging. In Biomedical Photonics Handbook, Second Edition :Fundamentals, Devices, and Techniques, Vo-Dingh T (ed), New York, CRC Press, 2014, 353-396 5) Soubor původních prací (Bude upřesněno). |
| Preliminary scope of work |
| Poruchy interakcí a oligomerizace jaderných a jadérkových proteinů často souvisí s jejich chybnou buněčnou lokalizací a následně se závažnými patogenními stavy. Nukleofosmin patří k vysoce zastoupeným proteinům jadérka putujícím mezi jadérkem, jádrem a cytoplazmou. Jeho schopnost oligomerizace je kritická pro správnou interakci s četnými vazebnými partnery, např. s proteiny signální kaskády spuštění programované buněčné smrti. Mutace, fúze nebo zvýšená úroveň exprese NPM úzce koreluje s výskytem nádorových onemocnění a leukémií.
Práce bude zaměřena především na oligomerizaci a interakce nukleofosminu, jeho mutovaných forem a fragmentů v živých buňkách. Chování nukleofosminu značeného vhodnými fluorescenčními proteiny bude sledováno moderními metodami časově rozlišené fluorescenční konfokální mikroskopie (FLIM, FRET-FLIM, polarizovaný FLIM). Měření budou prováděna v laboratořích FÚ ve spolupráci s Ústavem hematologie a krevní transfuze v Praze. |