Morphological and molecular diversity of the free-living representatives of the family Metopidae and the discovery of a new lineage of anaerobic ciliates
Thesis title in Czech:
Morfologická a molekulární diverzita volně žijících zástupců čeledi Metopidae a objev nové linie anaerobních nálevníků
Thesis title in English:
Morphological and molecular diversity of the free-living representatives of the family Metopidae and the discovery of a new lineage of anaerobic ciliates
hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
Date of registration:
12.11.2013
Date of assignment:
15.01.2014
Date of electronic submission:
04.05.2015
Date of proceeded defence:
08.06.2015
Opponents:
RNDr. Ivan Fiala, Ph.D.
Preliminary scope of work
Na PřF UK jsou k dispozici kultury obsahující zástupce třídy Armophorea. Z těchto nálevníků bude určena sekvence SSU rDNA a bude charakterizována světelně-mikroskopická morfologie. Získaná sekvenční data budou použita pro tvorbu fylogenetických stromů. Budou navrženy PCR primery specifické pro třídu Armophorea a budou následně použity pro environmentální identifikaci těchto nálevníků ve vzorcích sladkovodních sedimentů. Práce se bude věnovat i dvěma nově objeveným hlubokým liniím anaerobních nálevníků (izoláty LARNAKA a MURANO). Kromě získání morfologických dat bude u těchto nových nálevníků studována i ultrastruktura pomocí transmisního elektronového mikroskopu.
Preliminary scope of work in English
Collection of cultures of anaerobic protists at the Faculty of Science, Charles University in Prague, contains multiple cultures of armophorid ciliates. SSU rDNA sequences of these organisms will be determined and phylogenetic trees will be constructed. In addition, light-microscopic morphology will be studied. PCR primers specific for the Armophorea will be designed and used for detection of armophorids in freshwater samples of hypoxic sediments. The project will be focused also on two newly discovered deep branches of anaerobic ciliates (strains LARNAKA and MURANO). In addition to morphological data, ultrastructure of these novel ciliates will be studied by means of transmission electron microscopy.
- assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval