Optimization of methods for analysis of early steps of mouse polymavirus life cycle

• Thesis title in Czech: Optimalizace metod pro studium časných fází životního cyklu myšího polyomaviru
• Thesis title in English: Optimization of methods for analysis of early steps of mouse polymavirus life cycle
• Key words: Myší polyomavius, minoritní proteiny, mutantní virus, Cre rekombináza, BrdU, EdU, Click Chemistry
• English key words: Mouse polyomavirus, minor proteins, mutant virus, Cre recombinase, BrdU, EdU, Click Chemistry
• Academic year of topic announcement: 2013/2014
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: angličtina
• Department: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
• Supervisor: RNDr. Hana Španielová, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor
• Date of registration: 10.11.2013
• Date of assignment: 11.12.2013
• Date of electronic submission: 14.08.2015
• Date of proceeded defence: 16.09.2015
• Opponents: RNDr. Šárka Němečková, DrSc.

Preliminary scope of work

Myší polyomavirus slouží jako model pro studium mnoha buněčných procesů a od viru odvozené virové kapsidy mohou sloužit pro cílenou dopravu látek do buněk. Tato práce by měla přispět k pochopení úlohy jednotlivých strukturních proteinů viru v procesech spojených s časnými kroky virové infekce, aby mohlo dojít k efektivnímu využití tohoto systému v zamýšlených aplikacích.
Konkrétně je náplní této práce následující:
Příprava virové mutanty postrádajíc minoritní virové proteiny pomocí již dříve vyvinutého systému založeného na Cre/LoxP rekombinaci.
Příprava virů s genomem značeným bromdeoxyuridinem (BrdU) nebo/a 5-ethynyl-2´-deoxyuridinem (EdU) pro diferenciální analýzu časných fází infekce divokého a mutantního viru pomocí elektronové infekce a konfokální fluorescenční mikroskopie.
Kryoelektronová mikroskopická analýza událostí spojených se vstupem viru a/nebo virového genomu do jádra.