Optimization of methods for analysis of early steps of mouse polymavirus life cycle
Thesis title in Czech: | Optimalizace metod pro studium časných fází životního cyklu myšího polyomaviru |
---|---|
Thesis title in English: | Optimization of methods for analysis of early steps of mouse polymavirus life cycle |
Key words: | Myší polyomavius, minoritní proteiny, mutantní virus, Cre rekombináza, BrdU, EdU, Click Chemistry |
English key words: | Mouse polyomavirus, minor proteins, mutant virus, Cre recombinase, BrdU, EdU, Click Chemistry |
Academic year of topic announcement: | 2013/2014 |
Thesis type: | diploma thesis |
Thesis language: | angličtina |
Department: | Department of Genetics and Microbiology (31-140) |
Supervisor: | RNDr. Hana Španielová, Ph.D. |
Author: | hidden - assigned by the advisor |
Date of registration: | 10.11.2013 |
Date of assignment: | 11.12.2013 |
Date of electronic submission: | 14.08.2015 |
Date of proceeded defence: | 16.09.2015 |
Opponents: | RNDr. Šárka Němečková, DrSc. |
Preliminary scope of work |
Myší polyomavirus slouží jako model pro studium mnoha buněčných procesů a od viru odvozené virové kapsidy mohou sloužit pro cílenou dopravu látek do buněk. Tato práce by měla přispět k pochopení úlohy jednotlivých strukturních proteinů viru v procesech spojených s časnými kroky virové infekce, aby mohlo dojít k efektivnímu využití tohoto systému v zamýšlených aplikacích. Konkrétně je náplní této práce následující: Příprava virové mutanty postrádajíc minoritní virové proteiny pomocí již dříve vyvinutého systému založeného na Cre/LoxP rekombinaci. Příprava virů s genomem značeným bromdeoxyuridinem (BrdU) nebo/a 5-ethynyl-2´-deoxyuridinem (EdU) pro diferenciální analýzu časných fází infekce divokého a mutantního viru pomocí elektronové infekce a konfokální fluorescenční mikroskopie. Kryoelektronová mikroskopická analýza událostí spojených se vstupem viru a/nebo virového genomu do jádra. |