Strukturní biologie komplexu potkaních NK buněčných receptorů NKR-P1B a Clrb

• Thesis title in Czech: Strukturní biologie komplexu potkaních NK buněčných receptorů NKR-P1B a Clrb
• Thesis title in English: Structural biology of complex of rat NK cell receptors NKR-P1B and Clrb
• Key words: NK buňka, receptor, NKR-P1, Clrb, HEK293, proteinová krystalografie
• English key words: NK cell, receptor, NKR-P1, Clrb, HEK293, protein crystallography
• Academic year of topic announcement: 2012/2013
• Thesis type: diploma thesis
• Thesis language: čeština
• Department: Department of Biochemistry (31-250)
• Supervisor: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D.
• Author: hidden - assigned by the advisor, waiting for guarantor's approval
• Date of registration: 07.11.2012
• Date of assignment: 07.12.2012
• Date of electronic submission: 19.05.2014
• Date of proceeded defence: 02.06.2014
• Opponents: RNDr. Marek Ingr, Ph.D.

Preliminary scope of work

Příprava rozpustných forem dvou lektinových receptorů potkaních NK buněk, NKR-P1B a Clrb, rekombinantní expresí pomocí tranzietní transfekce buněčné linie HEK293. Příprava fúzních konstruktů těchto receptorů a následná purifikace dimerních forem těchto receptorů pomocí afinitní a HPLC chromatografie. Charakterizace komplexu biofyzikálními metodami (např. analytická ultracentrifugace, rezonance povrchového plazmonu, hmotnostní spektrometrie) a strukturní studium rClrb a jeho komplexu s NKR-P1B pomocí proteinové krystalografie.

Preliminary scope of work in English

Preparation of soluble forms of two lectin receptors of rat NK cells, NKR-P1B and Clrb, by recombinant expression using transient transfection of HEK293 cell line. Preparation of fusion constructs of these receptors and subsequent purification of dimeric receptors by affinity and HPLC chromatography. Characterization of the protein complex by biophysical methods (e.g. analytical ultracentrifugation, surface plasmon resonance, mass spectrometry) and structural study of rClrb and its complex with NKR-P1B by protein crystallography.