Hlavním předmětem doktorského studia Lucie Motlové bude konformace adenylátcyklázového CyaA toxinu Bordetella pertussis. Tento klíčový virulenční faktor původce černého kašle je v naší skupině už dlouho studován ve spolupráci s MBÚ AV ČR (Laboratoř molekulární biologie bakteriálních patogenů , vedoucí Ing. Peter Šebo, CSc.). Zároveň bylo toto téma L. Motlovou zkoumáno už v diplomové práci. Hlavní metodou studia konformace bude fluorescenční spektroskopie, jak tradiční, tak časově rozlišená, doplněná molekulárním modelováním. Druhým projektem bude zavedení rutinních měření parametrů pórů tvořených membránovými proteiny na černých lipidických membránách. Aparatura k tomuto měření se staví na Katedře genetiky a mikrobiologie. Oba projekty budou pracovat se stejným materiálem – mutantami proteinu CyaA – a poskytnou komplementární informace.