Mikrokalorimetrické stanovení termodynamické stability triplexu RNA
| Název práce v češtině: | Mikrokalorimetrické stanovení termodynamické stability triplexu RNA |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Microcalorimetric determination of RNA triplex thermodynamic stability |
| Akademický rok vypsání: | 2007/2008 |
| Typ práce: | bakalářská práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Fyzikální ústav UK (32-FUUK) |
| Vedoucí / školitel: | prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
| Datum přihlášení: | 05.10.2007 |
| Datum zadání: | 05.10.2007 |
| Datum a čas obhajoby: | 17.09.2008 00:00 |
| Datum odevzdání elektronické podoby: | 17.09.2008 |
| Datum odevzdání tištěné podoby: | 17.09.2008 |
| Datum proběhlé obhajoby: | 17.09.2008 |
| Oponenti: | RNDr. Eva Kočišová, Ph.D. |
| Zásady pro vypracování |
| 1. Seznámit se s problematikou strukturního uspořádání dvojité a trojité šroubovice nukleových kyselin.
2. Seznámit se s obsluhou mikrokalorimetru (DSC). 3. Na modelovém systému syntetických polynukleotidů proměřit teplotně indukovaný rozpad komplexu při různém stechiometrickém složení vzorku a určit termodynamické parametry 1:1 a 1:2 stechiometrických forem komplexů. |
| Seznam odborné literatury |
| 1. W. Saenger: Principles of nucleic acid structure. Springer, New York 1988 (vybrané části)
2. J. Palacký: Spektroskopické studium nových modifikovaných oligonukleotidů. Diplomová práce. MFF UK, Praha 2005 3. Vybraný soubor původních prací. |
| Předběžná náplň práce |
| Kromě známé dvojšroubovice jsou nukleové kyseliny schopné vytvářet i jiné typy vícemolekulárních komplexů.
Jedním z nich je trojitá šroubovice tvořená jedním vláknem s purinovými a dvěma vlákny s pyrimidinovýmí bázemi. Umělé vytvoření této struktury je jedním z uvažovaných mechanismů oligonukleotidové terapie. Na rozdíl od dvojšroubovice je však známo poměrně málo o termodynamické stabilitě triplexu a jejímu ovlivnění podmínkami prostředí. Cílem bakalářské práce je provedení mikrokalorimetrických měření na sadě směsných polynukleotidových roztoků a určení termodynamických parametrů spojených s připojením třetího řetězce k dvojšroubovici. |