Mikrokalrimetrické stanovení změn energie při tvorbě duplexu DNA

• Název práce v češtině: Mikrokalrimetrické stanovení změn energie při tvorbě duplexu DNA
• Název v anglickém jazyce: Microcalorimetric determination of energy changes at DNA duplex formation
• Akademický rok vypsání: 2006/2007
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Fyzikální ústav UK (32-FUUK)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 26.10.2006
• Datum zadání: 26.10.2006
• Datum a čas obhajoby: 25.06.2007 00:00
• Datum odevzdání elektronické podoby: 31.05.2007
• Datum odevzdání tištěné podoby: 31.05.2007
• Datum proběhlé obhajoby: 25.06.2007
• Oponenti: RNDr. Vladimír Kopecký, Ph.D.

Zásady pro vypracování

1. Seznámit se s problematikou tvorby duplexu molekuly DNA.
2. Seznámit se s obsluhou mikrokalorimetru (DSC).
3. Na modelovém systému syntetických komplementárních řetězců proměřit tání komplexu
a stanovit termodynamické parametry spojené s tvorbou komplexu.

Seznam odborné literatury

1. W. Saenger: Principles of nucleic acid structure. Springer, New York 1984
2. J. Palacký: Spektroskopické studium nových modifikovaných oligonukleotidů. Diplomová práce. MFF UK, Praha 2005
3. J. Kvasnica: Termodynamika a statistická fyzika. SNTL, Praha 1961

Předběžná náplň práce

Práce je zvláště vhodná pro zájemce o magisterské studium v zaměření BIOFYZIKA.
Jednou z nejvýznamnějších vlastností nukleových kyselin je jejich schopnost vytvářet dvojšroubovici (duplex) dvou řetězců s komplementárním bázovým složením. Existuje několik experimentálních technik, které mohou
ento proces sledovat. Pouze kalorimetrické metody však umožňují přesné určení termodynamických parametrů spojených s tvorbou duplexu. Na pracovišti je nově zakoupen mikrokalorimetr umožňující citlivá a přesná měření na kompexech biomolekul. Cílem bakalářské práce je prověření zařízení a získání termodynamických parametrů pro použité oligonukleotidy.