Přirozeně zabíječské buňky (NK buňky) hrají klíčovou roli v přirozené imunitě. NK receptory na jejich povrchu rozpoznávají poškozené nebo maligně pozměněné buňky a aktivují cytotoxické mechanizmy, které navodí apoptózu v cílové buňce. Jedním takovým receptorem je protein NKp80, který rozpoznává svůj ligand AICL. Hlavním cílem práce je vyřešení krystalové struktury ligandu AICL, potažmo jeho komplexu s NKp80 a objasnění jejich interakčního rozhraní. K produkci proteinů bude použit expresní systém buněčné linie HEK293 s tvorbou stabilních linií. Vedlejším cílem může být studium interakce obou proteinů na povrchu buněk pomocí jednomolekulové lokalizační mikroskopie.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Natural killer cells (NK cells) play a crucial role in innate immunity. NK receptors on the cell surface promote recognition of stressed or malignantly transformed cells and trigger cytotoxic mechanisms, leading to apoptosis in the target cell. One of these receptors is the NKp80 protein, recognizing its ligand AICL. The main objective of the thesis is to solve the crystal structure of the AICL ligand and, if possible, its complex with NKp80 and explain their interaction interface. An expression system of HEK293 human cell line with stable cell line generation will be used to produce proteins. A secondary goal may be to study the interaction of the two proteins on the cell surface using single-molecule localization microscopy.
