 | Ve čtvrtek dne 4. září 2025 v době od 20:00 do 22:00 dojde k odstávce webového prostředí a databáze systému WhoIs. Odstávka systému WhoIs se dotkne též systému IS Studium. Kromě omezení funkcionality související s napojením na WhoIs nebude ve většině případů možné odevzdávání závěrečných prací. Omlouváme se za komplikace a děkujeme všem, kterých se odstávka jakkoliv dotkne, za pochopení. |
Chemická modifikace glykopeptidů a predikce jejich retenčního chování při hydrofilní kapalinové chromatografii
| Název práce v češtině: | Chemická modifikace glykopeptidů a predikce jejich retenčního chování při hydrofilní kapalinové chromatografii |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Chemical Modification of Glycopeptides and Prediction of Their Retention on Hydrophilic Liquid Chromatography |
| Klíčová slova: | chemická modifikace glykopeptidů, predikce retence, hydrofilní kapalinová chromatografie |
| Klíčová slova anglicky: | Glycopeptide Modification, Retention Prediction, Hydrophilic Liquid Chromatography |
| Akademický rok vypsání: | 2024/2025 |
| Typ práce: | diplomová práce |
| Jazyk práce: | čeština |
| Ústav: | Katedra biochemie (31-250) |
| Vedoucí / školitel: | RNDr. Tomáš Ječmen, Ph.D. |
| Řešitel: | |
| Konzultanti: | doc. RNDr. Petr Kozlík, Ph.D. |
| Seznam odborné literatury |
| Petroušek F.: Rozvoj techniky separace a identifikace glykopeptidů pomocí chromatografie a hmotnostní spektrometrie pro klinické účely (diplomová práce, PřF UK, 2022) Pála A.: Chemická modifikace glykopeptidů a predikce jejich retenčního chování při hydrofilní kapalinové chromatografii (bakalářská práce, PřF UK, 2023) Kozlik P. et al.: Prediction of Intact N-Glycopeptide Retention Time Windows in Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography (Molecules, 2022, Jun 9;27(12):3723, doi: 10.3390/molecules27123723) |
| Předběžná náplň práce |
| Náplní práce bude získání glykopeptidů proteolýzou standardních glykoproteinů, chemická modifikace jejich peptidové páteře (např. propionylace, formylace, esterifikace) a sledování vlivu těchto modifikací na retenci při hydrofilní kapalinové chromatografii ve spojení s hmotnostně-spektrometrickou detekcí. Konečným cílem je využití posunů v retenčních časech k vytvoření modelu predikce chromatografického chování glykopeptidů, který může následně sloužit v klinické diagnostice ke zvýšení spolehlivosti identifikace málo abundantrních glykopeptidů. Projekt probíhá ve spolupráci s Katedrou analytické chemie PřF UK. |
| Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
| The scope of the work will be to obtain glycopeptides by proteolysis of standard glycoproteins, chemical modification of their peptide backbone (e.g. propionylation, formylation, esterification) and monitoring the effect of these modifications on retention by hydrophilic liquid chromatography in coupled with mass spectrometric detection. The ultimate goal is to use shifts in retention times to develop a model for predicting the chromatographic behavior of glycopeptides, which can then be used in clinical diagnostics to increase the reliability of identification of low abundant glycopeptides. The project is carried out in collaboration with the Department of Analytical Chemistry, Faculty of Science, Charles University. |