Úloha RNA demetylázy FTO v regulaci mitochondriální dynamiky v in vitro modelu lidských astrocytů

• Název práce v češtině: Úloha RNA demetylázy FTO v regulaci mitochondriální dynamiky v in vitro modelu lidských astrocytů
• Název v anglickém jazyce: The role of RNA demethylase FTO in the regulation of mitochondrial dynamics in an in vitro model of human astrocytes
• Klíčová slova: Mitochondriální fúze a dělení
• Klíčová slova anglicky: Mitochondrial fusion and fission
• Akademický rok vypsání: 2023/2024
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra fyziologie (31-152)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Petr Telenský, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 31.10.2023
• Datum zadání: 31.10.2023
• Datum potvrzení stud. oddělením: 03.01.2024

Předběžná náplň práce

Na lidských astrocytomových buňkách CCF-STTG1 bude charakterizována role FTO a m6A dráhy následujícími metodami:
1. Vliv m6A dráhy na dynamiku mitochondrií: Budou použity jak farmakologické (inhibitor MO-I-500), tak techniky manipulace exprese pro FTO. Budou analyzovány markery fúze mitochondrií (Mfn1, Mfn2, Opa1) a štěpení (Drp1, Mff, Mid, Fis1). Budou měřeny hladiny ATP, životaschopnost buněk a oxidativní stres.
2. Efekty farmakologické indukce mitofagie: Ověření indukce mitofagie Kaemferolem a Rhapontigeninem. Stanovení markerů mitofagie a exprese regulátorů m6A dráhy.
3. Analýza m6A epitranskriptomu: RNA bude izolována, následně bude provedena extrakce mRNA a hodnocena kvalita. Budou připraveny NGS knihovny a provedena analýza MeRIP. Vzorky budou odeslány k sekvenaci, následně bude provedena epitranskriptomická analýza.