Importance of CIA pathway proteins in the formation of Fe-S clusters in the nuclei of Giardia intestinalis.

• Název práce v češtině: Úloha proteinů CIA dráhy při tvorbě Fe-S klastrů v jádrech Giardia intestinalis.
• Název v anglickém jazyce: Importance of CIA pathway proteins in the formation of Fe-S clusters in the nuclei of Giardia intestinalis.
• Klíčová slova: Giardia intestinalis, Fe-S klastr, CIA dráha, jaderné proteiny, Nbp35, knock-out, mitozom.
• Klíčová slova anglicky: Giardia intestinalis, Fe-S cluster, CIA pathway, nuclear proteins, Nbp35, knock-out, mitosome.
• Akademický rok vypsání: 2023/2024
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra parazitologie (31-161)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Pavel Doležal, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 25.10.2023
• Datum zadání: 25.10.2023
• Datum potvrzení stud. oddělením: 03.01.2024
• Datum odevzdání elektronické podoby: 08.08.2025
• Oponenti: RNDr. Alena Panicucci Zíková, Ph.D.
• Konzultanti: Mgr. Martin Benda, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Cílem této práce je charakterizovat úlohu vybraných proteinů z dráhy CIA při tvorbě Fe-S klastrů na jaderných proteinech u anaerobního parazita Giardia intestinalis. Student se pokusí a) vyřadit vybrané geny kódující komponenty CIA dráhy b) identifikovat vhodný jaderný Fe-S protein, který by mohl být použit jako marker pro tvorbu Fe-S klastrů in vivo c) provést test tvorby Fe-S klastrů u vytvořených mutantních buněčných linií s použitím vybraného jaderného proteinu

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Aim of this work is to characterize the role of selected proteins from the CIA pathway during the formation of Fe-S clusters on the nuclear protein(s) in the anaerobic parasite Giardia intestinalis. The student will attempt to a) knock out selected genes encoding components of the putative CIA pathway b) identify suitabe nuclear Fe-S protein that could be used as a marker for the in vivo Fe-S cluster formation c) assay the Fe-S formation in the established knock-out cell lines using the selected nuclear protein(s).