Dlouhodobý mírný stres v koloniích Saccharomyces cerevisae s delecí WHI3

• Název práce v češtině: Dlouhodobý mírný stres v koloniích Saccharomyces cerevisae s delecí WHI3
• Název v anglickém jazyce: Long term sublethal stress in colonies of Saccharomyces cerevisiae deleted in WHI3
• Klíčová slova: kvasinkové kolonie, vrásčitá struktura, stresové podmínky, genová exprese, FLO11, WHI3, MPT5, YAP6,
• Klíčová slova anglicky: yeast colony, structured morphology,stress conditions, gene expression, FLO11, WHI3, MPT5, YAP6,
• Akademický rok vypsání: 2021/2022
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Michaela Schierová, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 13.11.2021
• Datum zadání: 03.12.2021
• Datum potvrzení stud. oddělením: 03.12.2021
• Datum odevzdání elektronické podoby: 12.12.2023
• Datum proběhlé obhajoby: 23.01.2024
• Oponenti: RNDr. Michala Dušková, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Protein Flo11 pozitivně ovlivňuje vznik vrásčité struktury kolonií Saccharomyces cerevisiae. Exprese genu FLO11 je regulována mnoha transkripčními faktory, z nichž některé jsou indukovány za stresových podmínek. Část těchto transkripčních faktorů je závislá na proteinu Whi3. Delece WHI3 vede za standardních podmínek kultivace ke zmenšení buněk, k redukci hladiny Flo11p v buňkách a k výraznému snížení vrásčitosti kolonií.
Cílem diplomové práce je zjistit, zda se u kmenů s delecí WHI3 mění exprese FLO11 při různých stresových podmínkách. Dalším cílem bude zjistit, zda je exprese FLO11 při stresu ovlivněna odlišně u kmenů se změnou genotypu YAP6 a MPT5. Hladina nebo aktivita proteinů Yap6 a Mpt5 je rovněž závislá na Whi3p a zároveň na stresových podmínkách. Funkce těchto proteinů však není v literatuře dobře popsána.
Za stejných stresových podmínek bude sledována hladina a lokalizace vybraných stresových proteinů, značených GFP u kolonií odvozených od laboratorního kmene BY4742.
Pro proteiny, které budou vybranými stresovými podmínkami nejvíce ovlivněny, budou u kmene s delecí WHI3 připraveny odpovídající varianty značené GFP. U těchto kmenů bude provedena obdobná analýza jako u kmene BY4742