Raman Microspectroscopy Data Processing
Název práce v češtině: | Zpracování dat z Ramanovy mikrospektroskopie |
---|---|
Název v anglickém jazyce: | Raman Microspectroscopy Data Processing |
Klíčová slova: | Raman|vibrační spektroskopie|spektrální analýza|aplikace|Python |
Klíčová slova anglicky: | Raman|vibrational spectroscopy|spectral analysis|application|Python |
Akademický rok vypsání: | 2020/2021 |
Typ práce: | bakalářská práce |
Jazyk práce: | angličtina |
Ústav: | Katedra teoretické informatiky a matematické logiky (32-KTIML) |
Vedoucí / školitel: | Mgr. Martin Pilát, Ph.D. |
Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
Datum přihlášení: | 21.09.2021 |
Datum zadání: | 28.09.2021 |
Datum potvrzení stud. oddělením: | 07.10.2021 |
Datum a čas obhajoby: | 17.06.2022 09:00 |
Datum odevzdání elektronické podoby: | 11.05.2022 |
Datum odevzdání tištěné podoby: | 16.05.2022 |
Datum proběhlé obhajoby: | 17.06.2022 |
Oponenti: | Mgr. Marta Vomlelová, Ph.D. |
Konzultanti: | RNDr. Ing. Jana Pilátová, Ph.D. |
Zásady pro vypracování |
Ramanova mikrospektroskopie umožňuje mikrospektroskopicky zkoumat chemické složení různých materiálů včetně mikroorganizmů. Výstup z takového mikroskopu potom je obraz, kde v každém bodě je změřené celé Ramanovo spektrum. Na základě tohoto spektra potom lze určit chemické složení v každém bodě obrazu. Velkým problémem ale je právě dávkové zpracování dat z takových mikroskopů. Cílem práce je tedy vytvořit program, který právě takové zpracování zjednoduší.
Student prozkoumá existující literaturu o zpracování Ramanovských spekter a existující software pro jejich zpracování. Na základě nabytých znalostí potom vytvoří aplikaci, která bude umožňovat zpracování Ramanovských mikrospektroskopických dat jak jednotlivě, tak dávkově. Práce bude vypracována ve spolupráci s Fyzikálním ústavem UK a podle požadavků jejích uživatelů. |
Seznam odborné literatury |
[1] Pan, Liangrui, Peng Zhang, Chalongrat Daengngam, Shaoliang Peng, and Mitchai Chongcheawchamnan. "A review of artificial intelligence methods combined with Raman spectroscopy to identify the composition of substances." Journal of Raman Spectroscopy (2021).
[2] Liu, Ya-Juan, Michelle Kyne, Cheng Wang, and Xi-Yong Yu. "Data mining in Raman imaging in a cellular biological system." Computational and Structural Biotechnology Journal, 18 (2020): 2920. |