Témata prací (Výběr práce)Témata prací (Výběr práce)(verze: 368)
Detail práce
   Přihlásit přes CAS
Analysis of serological cross-reactivity between antibodies against BK polyomavirus variants
Název práce v češtině: Analýza zkřížené sérologické reaktivity protilátek proti variantám BK polyomaviru
Název v anglickém jazyce: Analysis of serological cross-reactivity between antibodies against BK polyomavirus variants
Klíčová slova: BK polyomavirus, BKPyV-I, BKPyV-IV, sérologie, ELISA, transplantace ledvin
Klíčová slova anglicky: BK polyomavirus, BKPyV-I, BKPyV-IV, serology, ELISA, kidney transplantation
Akademický rok vypsání: 2020/2021
Typ práce: diplomová práce
Jazyk práce: angličtina
Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
Vedoucí / školitel: RNDr. Lenka Horníková, Ph.D.
Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
Datum přihlášení: 09.11.2020
Datum zadání: 09.11.2020
Datum potvrzení stud. oddělením: 09.11.2020
Datum odevzdání elektronické podoby:04.01.2023
Datum proběhlé obhajoby: 25.01.2023
Oponenti: RNDr. Kateřina Roubalová, Dr., CSc.
 
 
 
Konzultanti: RNDr. Hana Španielová, Ph.D.
Mgr. Alžběta Hejtmánková
Ocenění:Práce byla navržena na ocenění
Předběžná náplň práce
BK virus (BKV) způsobuje nefropatie při transplantacích ledvin. Při infekci pacientů i zdravých dárců může u BKV docházet ke vzniku mutací, které napomáhají nově vzniklým variantám viru při úniku z imunitního dohledu a udělují viru selektivní výhodu pro následné re-infekce napadené tkáně. To může ovlivňovat návrh diagnostických testů, efektivních vakcín i antivirotických přístupů při managementu potransplantačních komplikací. Zadaný projekt se proto zaměřuje na pochopení vlivu mutací v antigenních determinantách BK viru. Cílem projektu je s využitím technologie přípravy pseudovirionů charakterizovat protilátkovou odpověď proti antigenům BK viru, které byly již dříve připraveny pomocí cílené mutageneze. Konkrétně se jedná o pseudoviriony odvozené od VP1 sérotypu BKV-IV, kde jsou v oblasti DE smyčky nebo EF smyčky aminokyseliny, které se v daném místě vyskytují pouze u subtypu BKV-I. V rámci projektu bude ověřena možnost využití pseudovirionů BKV-IV mutovaných v DE smyčce jako tzv. vysycovacího antigenu pro možný diagnostický ELISA test, který by dokázal odlišit přítomnost protilátek proti BKV sérotypu I a IV. Pseudoviriony s touto mutací vykazují oproti nemutovaným antigenům typu BKV-I a BKV-IV vyšší křížovou reaktivitu s protilátkami cirkulujícími v populaci, a proto by mohly efektivně vychytávat křížově reagující protilátky v sérech před jejich testováním na přítomnost subtypově specifických protilátek. Pseudoviriony s mutací v EF-smyčce BKV-IV VP1 naopak vykazovaly v předběžných experimentech velmi nízkou reaktivitu s dostupnými lidskými a králičími séry, a proto je hlavním cílem práce ověřit jejich interakce s anti-BKV protilátkami ve zdravé lidské populaci, u transplantovaných pacientů a v hyperimunním králičím séru, které bude proti této variantě BK pseudovirionů připraveno v rámci projektu.
 
Univerzita Karlova | Informační systém UK