Vliv deadenylázy Ccr4 na regulaci buněčného cyklu v kvasinkových koloniích

• Název práce v češtině: Vliv deadenylázy Ccr4 na regulaci buněčného cyklu v kvasinkových koloniích
• Název v anglickém jazyce: Role of Ccr4 deadenylase in cell cycle regulation in yeast colonies
• Klíčová slova: deadenylace mRNA, kvasinkové kolonie, Saccharomyces cerevisiae
• Klíčová slova anglicky: mRNA deadenylation, yeast colony, Saccharomyces cerevisiae
• Akademický rok vypsání: 2020/2021
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Michal Čáp, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 02.11.2020
• Datum zadání: 02.11.2020
• Datum odevzdání elektronické podoby: 25.04.2022
• Datum proběhlé obhajoby: 24.05.2022
• Oponenti: RNDr. Martin Převorovský, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Náplní práce je hlubší studium fenotypu deleční mutanty v genu CCR4, který kóduje mRNA deadenylázu Ccr4p. Předběžné výsledky naznačují novou roli této deadenylázy z CCR4-NOT komplexu v regulaci buněčného cyklu u kvasinek. Fenotyp delečního kmene ccr4Δ lze pozorovat především na buňkách v koloniích a to naznačuje specifickou regulaci buněčného cyklu především v podmínkách pomalého růstu za sníženého přísunu živin, jak k tomu dochází právě v buňkách kolonie v kontrastu k suspenzním třepaným kultivacím. Úlohou řešitele bude vytvoření sady dvojitě delečních mutant v genu CCR4 a dalších genech, které v celogenmomových screenech vykazovaly genetické interakce a/nebo zajímave fenotypy. Tyto kmeny budou jednak sloužit jako ověření výsledků celogenomových screenů a jednak poslouží pro studium buněčného cyklu pomocí průtokové cytomertrie.