Intermediate filament proteins of Preaxostyla flagellates

• Název práce v češtině: Proteiny intermediárních filament bičíkovců ze skupiny Preaxostyla
• Název v anglickém jazyce: Intermediate filament proteins of Preaxostyla flagellates
• Klíčová slova: Cytoskelet, Preaxostyla, proteomika, cytoskeletální kořeny, buněčná frakcionace
• Klíčová slova anglicky: Cytoskeleton, Preaxostyla, proteomics, cytoskeletal roots, cell fractionation
• Akademický rok vypsání: 2020/2021
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra parazitologie (31-161)
• Vedoucí / školitel: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 29.10.2020
• Datum zadání: 02.11.2020
• Datum potvrzení stud. oddělením: 02.11.2020
• Datum odevzdání elektronické podoby: 26.04.2023
• Datum proběhlé obhajoby: 29.05.2023
• Oponenti: Mgr. Vladimír Varga, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Náplní práce bude příprava nabohacené cytoskeletální frakce zástupců skupiny Preaxostyla - Monocercomonoides exilis a Paratrimastix pyriformis - a následná charakterizace jejího proteinového složení pomocí hmotnostní spectrometrie. Cílem je odhalit proteinové komponenty některých z cytoskeletálních struktur asociovaných s mikrotubulárními kořeny, zejména I fibrily (preaxostyl), B-, C-fibrily a dalších. Proti nadějným kandidátům budou vytvořeny protilákty s cílem ověřit jejich lokalizaci pomocí imunofluorescence.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

The scope of work will be the preparation of an enriched cytoskeletal fraction of the Preaxostyla flagellates - Monocercomonoides exilis and Paratrimastix pyriformis - and subsequent characterization of its protein composition by mass spectrometry. The aim is to reveal the protein components of some of the cytoskeletal structures associated with microtubular roots, especially I fibrils (preaxostyl), B-, C-fibrils and others. Antibodies will be generated against promising candidates in order to verify their localization by immunofluorescence.