Effect of endosymbionts on composition and properties of Trichomonas vaginalis exosomes

• Název práce v češtině: Vliv endosymbiontů na složení a vlastnosti exosomů Trichomonas vaginalis
• Název v anglickém jazyce: Effect of endosymbionts on composition and properties of Trichomonas vaginalis exosomes
• Klíčová slova anglicky: endosymbionts, dsRNA virus, TVV, mycoplasma, exosome, parasite, Trichomonas vaginalis, bioinformatics
• Akademický rok vypsání: 2020/2021
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Jan Tachezy, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 15.10.2020
• Datum zadání: 19.10.2020
• Datum odevzdání elektronické podoby: 11.08.2022
• Datum proběhlé obhajoby: 13.09.2022
• Oponenti: prof. RNDr. Jan Černý, Ph.D.
• Konzultanti: RNDr. Petr Rada, Ph.D.

Zásady pro vypracování

Biologie parazitickych protist
Methods of functional genomics (MB140P86)
Imunologii parazitárních nákaz I a II (MB160P35 a MB160S70)

Předběžná náplň práce

Práce bude zaměřena především na komparativní proteomiku a transkriptomiku exosomů, izolovaných z klonů T. vaginalis a to z klonů, které nemají endosymbionty a ty co je mají (např. dsRNA virus, mycoplasma) a stejně tak z klonů s různou mírou virulence. Rovnež bude studována imunitní odpověď VEC buněk na expozici exosomů. Práce bude vyžadovat bioinformatické znalosti pro porovnávání hrubých dat, anotace, characteriace pomocí různých bioinformatických nástrojů atd. Vybrané proteiny (geny), které se budou výrazně lišit v expresi budou dále funkčně studovány. Předpokládá se absolvování bioinformatických kurzů v rámci spolupráce s EMBL.