Interakce proteinů Whi3 a Yap6 při mírném osmotickém stresu

• Název práce v češtině: Interakce proteinů Whi3 a Yap6 při mírném osmotickém stresu
• Název v anglickém jazyce: Interaction of Whi3 and Yap6 under mild osmotic stress
• Klíčová slova: morfologie kolonií, signální dráha filamentárního růstu, osmotický stres,fluorescenční proteiny, Saccharomyces cerevisiae
• Klíčová slova anglicky: colony morphology, filamentous pathway, osmotic stress,fluorescent stress, Saccharomyces cerevisiae
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Michaela Schierová, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 14.11.2019
• Datum zadání: 10.12.2019
• Datum odevzdání elektronické podoby: 26.04.2021
• Datum proběhlé obhajoby: 26.05.2021
• Oponenti: doc. RNDr. Olga Heidingsfeld, CSc.

Předběžná náplň práce

Protein Whi3 je RNA vazebný protein, ovlivňující nejen velikost a tvar buněk, ale i produkci sekretovaných proteinů a v neposlední řadě i morfologii kolonií. Několika nezávislými signálními drahami ovlivňuje transkripci významného genu FLO11, jehož exprese je charakteristická pro buňky strukturovaných kolonií. Protein Yap6 je transkripční faktor s pozitivními i negativními účinky, jehož hladina je je zvýšená u kmene s delecí WHI3. Protein interaguje s Tup1-Cyc8 a podílí se na regulaci metabolismu uhlíku, rovněž zvyšuje osmotoleranci. Mimo jiné, exprese YAP6 je regulována Sok2p, takže je jeho regulace závislá i na signální dráze zprostředkované Yak1p a tedy i Whi3p. Mezi cílové geny proteinu Yap6 patří TEC1, PHD1, FLO8, STE2, STE7, STE12 a STE18, které jsou zapojeny do filamentárního růstu.
Cílem diplomové práce bude zjistit, zda se interakce Whi3 a Yap6 mění v závislosti na stáří kolonie, zdroji uhlíku v médiu, teplotě při kultivaci atd.
Dílčí cíle:
Připravit kmeny s mutacemi YAP6, produkující fluorescenčně značený Flo11p.
Analyzovat produkci Flo11p kolonií kmenů různého genotypu (WHI3, YAP6 - delece genů, zvýšená exprese) během kultivace za standardních i stresových podmínek.
Charakterizovat morfologii kolonií vybraných kmenů s mutacemi WHI3 a YAP6 a sledovat jejich citlivost vůči osmotickému stresu.