Porovnání metabarcodingu a morfologických přístupů pro analýzu diverzity společenstev protist

• Název práce v češtině: Porovnání metabarcodingu a morfologických přístupů pro analýzu diverzity společenstev protist
• Název v anglickém jazyce: A comparison of metabarcoding and morphology‐based identification of protist communities
• Klíčová slova: metabarcoding, diverzita, protista, mikroskopie, taxonomie, enviromentální DNA (= eDNA), morfologické určení druhů, 18S rRNA
• Klíčová slova anglicky: metabarcoding, protists, diversity, microscopy, taxonomy, environmental DNA (= eDNA), morphology-based identification, 18S rRNA
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra botaniky (31-120)
• Vedoucí / školitel: doc. Mgr. Pavel Škaloud, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 08.11.2019
• Datum zadání: 08.11.2019
• Datum odevzdání elektronické podoby: 08.06.2020
• Datum proběhlé obhajoby: 09.07.2020
• Oponenti: Mgr. Jana Steinová, Ph.D.

Seznam odborné literatury

Pierre Taberlet, Aurélie Bonin, Lucie Zinger, and Eric Coissac: Environmental DNA For Biodiversity Research and Monitoring, 2018.
Samostatně nalezené publikace týkající se tématu práce.

Předběžná náplň práce

Cílem práce je porovnání metabarcodingu a morfologických přístupů pro analýzu diverzity společenstev protist. V první kapitole bude definován princip metabarcodingu, specifikovány otázky na které nám tato metoda může pomoci najít odpovědi, a charakterizovány pozitiva a negativa použití metabarcodingu pro analýzu společenstev protist. Dále se tato kapitola zaměří na možnosti analýz získaných dat. Druhá kapitola bude představovat rešerši publikací, které porovnávaly metabarcoding s analýzou společenstev za použití tradičních mokroskopických technik. V závěru práce řešitelka shrne získané poznatky a uvede možná vysvětlení nesrovnalostí mezi výsledky analýz společenstev za použití dvou výše zmíněných přístupů.