Cílem práce je vytvořit nové producenty hybridních manumycinů pro testování jejich biologických aktivit - antibakteriální, protinádorové a protizánětlivé. Pomocí vhodných genových manipulací budou vytvářeny geneticky modifikované produkční kmeny, které připojují k dolnímu polyketidovému řetězci alternativní cyklické jednotky se zaměřením na již známé vhodné farmakofory. Toto je možné díky relaxované specifitě připojující amidsyntázy, případně lze používat amidsyntáz z biosyntetických genových shluků pro jiné sekundární metabolity. Postup lze dále kombinovat se suplementací produkčních kmenů vhodnými prekurzory.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The aim of the work is to design novel producers of hybrid manumycins for bioactivity assays - antibacterial, cancerostatic, anti-inflammatory. With the help of suitable genetic manipulations we will prepare genetically modified producers strains, which attach alternative cyclic units to the lower polyketide chain, preferably those known as suitable pharmacophores. This can be accomplished mainly due to the relaxed specificity of the responsible amide synthase, alternatively we can use amide synthases encoded in other biosynthetic gene clusters for different metabolites. The method can be further combined with supplementation of producer strains with suitable precursors.