Structural and biophysical characterisation of Siglec-7, an inhibitory NK cell receptor: insights into stability, dimerisation, and ligand binding

• Název práce v češtině: Strukturní a biofyzikální charakterizace Siglec-7, inhibičního receptoru NK buněk: poznatky o stabilitě, dimerizaci a vazbě ligandu
• Název v anglickém jazyce: Structural and biophysical characterisation of Siglec-7, an inhibitory NK cell receptor: insights into stability, dimerisation, and ligand binding
• Klíčová slova: Siglec-7, NK buňky, dimerizace, izotopové značení, NMR spektroskopie
• Klíčová slova anglicky: Siglec-7, NK cells, dimerisation, isotope labelling, NMR spectroscopy
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 04.10.2019
• Datum zadání: 04.10.2019
• Datum odevzdání elektronické podoby: 19.04.2025
• Datum proběhlé obhajoby: 25.06.2025
• Oponenti: RNDr. Cyril Bařinka, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Strukturní informace týkající se interakcí mezi NK buněčnými receptory a jejich ligandy jsou v literatuře stále neúplné. Struktura vazebné domény inhibičního NK buněčného receptoru Siglec-7 sice již byla popsána, avšak informace o jeho celkové struktuře a molekulárních detailech jeho interakcí se sacharidovými ligandy jsou v současné době stále velmi omezené. Porozumění interakcím mezi NK buněčnými receptory a jejich ligandy je přitom základem pro vývoj nových imunoterapií. Cílem práce je připravit stabilní rozpustné formy Siglec-7 vhodné pro jejich další strukturní a funkční výzkum, a s jejich pomocí objasnit, jak Siglec-7 rozeznává sacharidové ligandy endogenního i patogenního původu, potažmo jakým způsobem probíhá ze strukturního hlediska přenos signálu do nitra buňky.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Structural information regarding the interactions between NK cell receptors and their ligands is still incomplete in the literature. Although the structure of the carbohydrate recognition domain of the inhibitory NK cell receptor Siglec-7 has been described, information on its overall structure and molecular details of its interactions with carbohydrate ligands is currently still very limited. However, understanding the interactions between NK cell receptors and their ligands is essential for the development of new immunotherapies. The aim of this work is to prepare stable soluble forms of Siglec-7 suitable for further structural and functional studies, and to elucidate how Siglec-7 recognizes carbohydrate ligands of endogenous and pathogenic origin, and also how signal transduction to the cell interior occurs from a structural point of view.