Rekombinační hot-spoty u různých organismů

• Název práce v češtině: Rekombinační hot-spoty u různých organismů
• Název v anglickém jazyce: Recombination hot-spots in various organisms
• Klíčová slova: crossing-over, dvouřetězcový zlom, evoluce, histonové modifikace, PRDM9 protein, preferenční místo, rekombinace
• Klíčová slova anglicky: crossing-over, double-strand break, evolution, histone modifications, PRDM9 protein, hot-spot, recombination
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: doc. RNDr. Dana Holá, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 22.10.2019
• Datum zadání: 09.12.2019
• Datum odevzdání elektronické podoby: 15.05.2020
• Datum proběhlé obhajoby: 10.07.2020
• Oponenti: Mgr. Martin Forman

Předběžná náplň práce

Práce se zabývá evolucí rekombinačních charakteristik genomu. Je známo, že rozložení crossing-overu a jeho frekvence jsou ovlivňovány řadou parametrů souvisejích s architekturou chromozomů a genomu (velikost genomu, distribuce heterochromatinu, histonové modifikace, pohlavní chromozomy, počet a morfologie chromozomů, chromozomové přestavby, kinetická organizace chromozomů), pohlavím (samice mají často vyšší frekvenci rekombinací), často i polohou rekombinačních míst, která mohou blokovat crossing-over ve svém okolí. V práci by měly být podrobně analyzovány různé vlastnosti míst v genomu různých organizmů, v nichž dochází preferenčně k rekombinacím (rekombinačních hotspotů), jejich sekvenční charakteristice a specifickým proteinům, které jsou s těmito místy spojeny.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Thesis is dealing with evolution of genomic recombination landscape. Distribution and frequency of crossing-overs are influenced by many parameters related to architecture of chromosomes and genome (genome size, distribution of heterochromatin, histone modifications, sex chromosomes, number chromosomes and their morphology, chromosome rearrangements, kinetic organization of chromosomes). sex (females exhibit usually higher frequency of chiasmata than males), and sites of crossing-over, which usually block origin of these events nearby. The thesis should bring summary information on recombination hotspots of various organisms, i.e. genomic locations with preferential recombination, their sequences and specific proteins associated with these hotspots.