Určení trojrozměrné struktury helikální domény proteinu Ddi2 (DNA damage-inducible protein 2)

• Název práce v češtině: Určení trojrozměrné struktury helikální domény proteinu Ddi2 (DNA damage-inducible protein 2)
• Název v anglickém jazyce: Structure determination of helical domain of DNA damage-inducible protein 2
• Klíčová slova: interakční partner, DNA
• Klíčová slova anglicky: interaction partner, DNA damage
• Akademický rok vypsání: 2015/2016
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Klára Grantz Šašková, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 19.10.2015
• Datum zadání: 19.10.2015
• Datum odevzdání elektronické podoby: 19.05.2016
• Datum proběhlé obhajoby: 13.06.2016
• Oponenti: prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Student vypracuje rešerši podrobně zaměřenou na popis proteinu "DNA damage-inducible protein homolog 2" (Ddi2) a dále na různé techniky hledání jeho vazebných partnerů, popřípadě substrátů. Experimentálně si osvojí základní klonovací techniky a manipulaci s DNA, přípravu rekombinantních proteinů a popřípadě další biochemické či biofyzikální metody určené k charakterizaci protein-proteinových interakcí.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Student should write a thesis focusing on DNA damage-inducible protein homolog 2 (Ddi2) and various techniques enabling a search for its binding partner/s or substrate/s. She or he will learn basis of cloning and DNA manipulation, recombinant protein preparation and further techniques for characterization of protein-protein interaction.