Vliv epigenetických modifikací na replikaci a transkripci DNA viru hepatitidy B

• Název práce v češtině: Vliv epigenetických modifikací na replikaci a transkripci DNA viru hepatitidy B
• Název v anglickém jazyce: Effect of epigenetic modifications on replication and transcription of hepatitis B virus DNA
• Klíčová slova: virus hepatitidy B (HBV); kovalentně uzavřená kruhová DNA HBV (cccDNA); replikace a transkripce HBV DNA; histonové modifikace; metylace CpG; CpG ostrovy; protein X HBV (HBx); kapsidový protein HBV (HBc); interferon alfa (IFNα); interleukin 6 (IL-6)
• Klíčová slova anglicky: hepatitis B virus (HBV); covalently closed circular HBV DNA (cccDNA); replication and transcription of HBV DNA; histone modifications; CpG methylation; CpG islands; HBV protein X (HBx); HBV capsid protein (HBc); interferon alpha (IFNα); interleukin 6 (IL-6)
• Akademický rok vypsání: 2015/2016
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Ivan Hirsch, CSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 17.10.2015
• Datum zadání: 17.10.2015
• Datum odevzdání elektronické podoby: 12.05.2016
• Datum proběhlé obhajoby: 07.06.2016
• Oponenti: Mgr. Kristina Roučová

Předběžná náplň práce

Cílem práce je provedení literární rešerše vlivu epigenetických modifikací DNA viru hepatitidy B na jeho replikaci a transkripci. Důraz bude kladen na analýzu údajů o vlivu miRNA, cytokinů, kapsidového proteinu HBV a X proteinu HBV na metylaci CpG ostrovů a na modifikace histonů. Vzhledem ke klíčové roli cccDNA pro udržení viru v lidském organizmu, bude studován vliv epigenetických modifikací na možnosti její destrukce a eradikace. V práci bude rovněž zohledněn vliv epigenetických modifikací na replikaci a genovou expresi HBV při akutní, chronické a okultní infekci.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Specific aim of this bibliographic analysis is to elucidate effects of epigenetic modifications of HBV DNA on virus replication and transcription. The work will specially analyze the data on the effects of miRNA, cytokines, the HBV capsid protein and the HBV X protein on methylation of CpG islands and histone modifications. Because of the central role of cccDNA for virus persistence in human organism, the work will study the effects of epigenetic modifications on its possible destruction and eradication. The research will also be focused on the effect of epigenetic modifications of HBV DNA during acute, chronic and occult infection.