Při řešení zadaného tématu půjde zejména o charakterizaci mutanta v podjednotce SEC15b poutacího komplexu exocyst. Charakterizace se bude týkat nejen biometrických dat na úrovni celé rostliny Arabidopis thaliana, ale také uspořádání jednotlivých buněčných kompartmentů. K tomu bude využita celá škála fluorescenčních markerů, které jsou již k dispozici. Paraleně se bude práce zabývat vztahem dvou paralogů SEC15 v Arabidopsis. Předběžná data naznačují, že tyto paralogy nejsou zcela redundantní, což budemem chtít potvrdit či vyvrátit prostřednictvím komplementace mutací těchto podjednotek. Zajímavé bude také sledovat důsledky přítomnosti částí proteinů SEC15 v buňce na integritu komplexu exocyst.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
This topic deals with characterization of the SEC15 subunit of the tethering complex exocyst in Arabidopsis thaliana. Aside of biometric measurements on the whole plant level, we will focus on arrangement of various compartments on the cellular level using fluorescent markers that are available in our laboratory. In parallel, we will investigate relationship of the two Arabidopsis SEC15 paralogues, SEC15a and SEC15b. Preliminary data suggest that these paralogues are not completely redundant. We would like to test this observation through complementation of mutations of these two subunits. We will also test the exocyst complex stability in presence of truncated versions of both exocyst SEC15 subunits.
- zadáno vedoucím/školitelem