Vliv acidifikace povrchových vod na vodní biotu je dobře popsán v mnoha pracech. Vyplývá z nich, že nejvíce ovlivněnou skupinou byly organismy volné vody (zooplankton a fytoplankton) a litorálů. Organismy žijící v nejhlubších částech horských jezer (zejména Chironomidae) nebyly acidifikací tak výrazně ovlivněny, a jejich druhové složení, zdá se, v době vrcholné acidifikace více odráželo změny spojené s dostupností potravy než s přímým vlivem okyselení. Druhy pakomárů silně acidifikovaných jezer však vykazovaly posun směrem k acidotolerantnějším skupinám. V současné době, kdy v postižených oblastech (Vysoké Tatry, Šumava) probíhá v jezerech zotavení z acidifikace, netrpělivě očekáváme znovuobjevení vymizelých zooplanktoních druhů, jako známky biologického zotavení těchto vodních ekosystémů, ale otázkou zůstává, jak tyto chemické a biologické změny zasáhnou profundální organismy. Místo druhových změn zde očekáváme spíše nárust biomasy, spojený s vyšší dostupností potravy, u původně silně acidifikovaných jezer bychom však taxonomické změny mohli očekávat.
- zadáno a potvrzeno stud. odd.