Ab initio predikce struktury membránových proteinů

• Název práce v češtině: Ab initio predikce struktury membránových proteinů
• Název v anglickém jazyce: Ab initio prediction of the membrane protein structures
• Klíčová slova: Predikce struktury membránových proteinů, ab initio predikce, Rosetta, EVfold, 3D-SPOT
• Klíčová slova anglicky: Structure prediction of membrane proteins, ab initio prediction, Rosetta, EVfold, 3D-SPOT
• Akademický rok vypsání: 2013/2014
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: doc. RNDr. Radovan Fišer, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem, čeká na schválení garantem
• Datum přihlášení: 01.04.2014
• Datum zadání: 01.04.2014
• Datum odevzdání elektronické podoby: 09.05.2016
• Datum proběhlé obhajoby: 08.06.2016
• Oponenti: RNDr. Vítězslav Plocek, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Do hloubky popsat reprezentativní programy pro ab initio predikci trojrozměrné struktury transmembránových proteinů a jeden si osvojit pro další výzkum, tedy úpravy algoritmitmů a dodatečnou analýzu predikovaných modelů, jako je například klastrování.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

In depth describe representative programs for ab initio prediction of the three dimensional structure of transmembrane proteins. One program will be used in further research, including algorithm modifications and additional analysis of predicted models, such as clustering.