Kombinovaný QM/MM popis interakcí organokovových léčiv na bázi 'piano-stool' Ru(II) komplexů s oligomerními modely DNK
Název práce v češtině: | Kombinovaný QM/MM popis interakcí organokovových léčiv na bázi 'piano-stool' Ru(II) komplexů s oligomerními modely DNK |
---|---|
Název v anglickém jazyce: | Combined QM/MM decsription of interaction of Ru(II) 'piano-stool' organometallic complexes with oligomer models of DNA |
Klíčová slova: | organorutheniové komplexy, quinolon, protirakovinné účinky, DFT |
Klíčová slova anglicky: | organoruthenium complexes, quinolone, anti-cancer treatment, DFT |
Akademický rok vypsání: | 2011/2012 |
Typ práce: | bakalářská práce |
Jazyk práce: | čeština |
Ústav: | Katedra chemické fyziky a optiky (32-KCHFO) |
Vedoucí / školitel: | prof. RNDr. Ing. Jaroslav Burda, DrSc. |
Řešitel: | skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd. |
Datum přihlášení: | 06.11.2011 |
Datum zadání: | 07.11.2011 |
Datum potvrzení stud. oddělením: | 16.04.2012 |
Datum a čas obhajoby: | 19.06.2012 00:00 |
Datum odevzdání elektronické podoby: | 28.05.2012 |
Datum odevzdání tištěné podoby: | 28.05.2012 |
Datum proběhlé obhajoby: | 19.06.2012 |
Oponenti: | RNDr. Vladimír Sychrovský, Ph.D. |
Zásady pro vypracování |
Práce bude založena na kombinovaných kvantově-mechanických/molekulárně-mechanických výpočtech tzv. "piano-stool" Ru(II) komplexů, u kterých byly nalezeny protirakovinné účinky. Pro tyto komplexy budou vypočteny termodynamická data, které hrají klíčovou úlohu při aktivaci a interakci léčiv s DNK/RNK sekvencemi. Zvolené komplexy budou nejprve podrobeny geometrické optimalizaci a pro finální struktury budou provedeny analýzy vlnových funkcí resp. elektronové hustoty pomocí různých výpočetních kvantově-mechanických programů. |
Seznam odborné literatury |
1. R. Polák, R. Zahradník: Základy kvantové chemie, SNTL Praha, 1993
2. P. Čárský, M. Urban: Ab initio výpočty v chemii, SNTL Praha, 1988 3. J. Fišer: Úvod do kvantové chemie, Academia Praha, 1983 4. N. Ostlund, A. Szabo: Modern Quantum Chemistry, McGraw-Hill Inc. New York, 1989 5. Yang, Parr: Density functional Theory, Wiley, NY, 1998 |